Le dossier pharmaceutique est l'une des composantes du futur dossier médical personnel (DMP), dont chaque Français devrait, à terme, être doté. Il s'agit en l'occurrence d'un dossier électronique de santé partagé et sécurisé. Ce dossier retrace l'ensemble des médicaments délivrés à un patient au cours des quatre derniers mois, ce qui permet au pharmacien de s'assurer qu'il n'existe pas de risque d'interactions médicamenteuses (effet cumulatif ou contradictoire de deux médicaments, qui risque de nuire à la santé du patient) et de repérer d'éventuels traitements redondants. Un dossier pharmaceutique ne peut toutefois être créé qu'avec l'accord explicite du patient. Il n'est consultable et modifiable que si la carte Vitale du patient et la "carte de professionnel de santé" du pharmacien sont introduites simultanément dans le lecteur.

Le dossier pharmaceutique a été lancé en 2006 à l'initiative du Conseil national de l'Ordre des pharmaciens, qui est chargé de le piloter. La Cnil (Commission nationale de l'informatique et des libertés) a autorisé, en décembre 2008, sa généralisation à toutes les pharmacies et un décret du 15 décembre 2008 rend désormais ce dossier obligatoire pour les officines. A ce jour, plus de 15.000 officines (soit les deux tiers des pharmacies) participent à l'opération et plus de huit millions de patients disposent d'un dossier pharmaceutique. Lorsqu'ils sont sollicités par le pharmacien, 85% des patients acceptent la création de leur dossier pharmaceutique.

Jusqu'à présent, le dossier pharmaceutique ne concernait que les officines de ville. Mais une décision de la Cnil du 6 mai 2010 autorise une expérimentation de ce dossier dans les hôpitaux. Celle-ci porte uniquement sur les médicaments délivrés par les pharmacies hospitalières dans le cadre des soins ambulatoires (consultations externes). L'intérêt ? : partager les informations entre la ville et l'hôpital. Ainsi, le dossier pharmaceutique retracera à la fois les médicaments délivrés par le pharmacien d'officine et ceux délivrés par son collègue de l'hôpital, ce qui offre une garantie supplémentaire pour déceler un risque d'éventuelles interactions médicamenteuses.

Cette expérimentation sera menée durant neuf mois dans dix départements des bassins de vie de Lorraine et de Méditerranée, puis de Paris et du Val-de-Marne. En pratique, elle va débuter dans les CHU de Nîmes et de Nancy au centre hospitalier d'Hyères (Var). Si les résultats sont positifs, une généralisation du dispositif à tous les hôpitaux pourrait être envisagée.